連云港邊防檢查站的前身是山東邊防保衛(wèi)局連云分局，組建于1951年5月1日，1952年7月正式改編為連云港邊防檢查站。

　　建站以來(lái)，先后進(jìn)行了多次體制調(diào)整和改編，現(xiàn)歸建中國(guó)人民武裝警察部隊(duì)序列，隸屬于江蘇公安邊防總隊(duì)，為一類站。連云港邊檢站所在口岸類型為水港（海港），種類為一類口岸，所轄水域面積29.7平方公里，現(xiàn)有各類碼頭泊位35個(gè)，其中萬(wàn)噸級(jí)以上泊位30個(gè)；與160多個(gè)國(guó)家和地區(qū)的港口建立通航關(guān)系，辟有歐洲、美洲、中東、東北亞、東南亞等集裝箱和貨運(yùn)班輪航線40多條，并開通了韓國(guó)仁川、平澤兩條大型客箱班輪航線，是全省既有船檢業(yè)務(wù)又有旅檢業(yè)務(wù)的海港邊檢站。